Συμμετείχε/συμμετέχει (κύρια ή συμμετέχουσα ερευνήτρια ή επιστημονική υπεύθυνη) σε 44 ερευνητικά προγράμματα (ευρωπαϊκά, διακρατικά, εθνικά ή αυτοχρηματοδοτούμενα), σε 20 εκ των οποίων ως επιστημονικά υπεύθυνη.
Τo ερευνητικό έργο της Δρ. Άννα Ψαρουλάκη έχει αναπτυχθεί στα πεδία της Κλινικής Μικροβιολογίας και της Μικροβιακής Παθογένεσης, της Μικροβιολογίας Δημόσιας Υγείας, της Επιδημιολογίας Λοιμωδών Νοσημάτων, και της Μικροβιολογίας Τροφίμων και Υδάτων και εστιάζει στη μελέτη παθογόνων μικροοργανισμών αιτιολογικών παραγόντων ζωονόσων, τροφιμογενών/υδατογενών παθογόνων, καθώς και νοσημάτων που μεταδίδονται μέσω διαβιβαστών (vector-borne diseases). Έχει τη δική της ερευνητική ομάδα στο Εργαστήριο Κλινικής Μικροβιολογίας και Μικροβιακής Παθογένεσης της Ιατρικής Σχολή του Πανεπιστημίου Κρήτης και η έρευνά της έχει λάβει σημαντική χρηματοδότηση.
Οι ερευνητικές δράσεις της ερευνητικής ομάδας της κ. Ψαρουλάκη αφορούν:
α) τη διερεύνηση μηχανισμών αλληλεπίδρασης παθογόνου-ξενιστή και η κατανόηση μηχανισμών ενδοκυττάριας επιβίωσης για ενδοκυττάρια βακτήρια. Μελετούνται τρία ενδοκυττάρια βακτήρια (C. burnetii, Brucella, Legionella) για τα οποία διερευνούνται μηχανισμοί παθογένειας και αντοχής στα αντιβιοτικά με τη χρήση διαφορετικών πειραματικών συστημάτων και Omics-Based μεθοδολογιών (γενωμική, πρωτεωμική, μεταβολωμική).
β) Σημαντικό πεδίο του ερευνητικού έργου της ερευνητικής ομάδας της είναι η διερεύνηση της επιδημιολογικής αλυσίδας μετάδοσης ζωονοτικών/ /τροφιμογενών/υδατογενών παθογόνων στη διασύνδεση «Άνθρωπος-Ζώα –Περιβάλλον» με στόχο την καλύτερη κατανόηση της μετάδοσης και διασποράς τους. Σε μια One Health προσέγγιση, με τη χρήση μεθόδων μοριακής επιδημιολογίας γαιοχωρικής ανάλυσης ,και μεθοδολογιών omics (γενωμική/ πρωτεωμική), διερευνάται η επιδημιολογική αλυσίδα μετάδοσης, διενεργώντας μελέτες σε όλους τους παράγοντες του κύκλου μετάδοσης (στελέχη από ασθενείς, ζώα και δείγματα περιβάλλοντος χαρακτηρίζονται και προσδιορίζονται οι φυλογενετικές σχέσεις τους και οι αλληλεπιδράσεις τους).
γ) H ερευνητική ομάδα αναπτύσσει ερευνητικές δράσεις στους τομείς Μικροβιολογίας Δημόσιας Υγείας, και της Υγιεινής και Ασφάλειας τροφίμων και νερού. Τα ερευνητικά ενδιαφέροντα της ομάδας περιλαμβάνουν την μελέτη και βελτίωση της μικροβιολογικής ασφάλειας των τροφίμων και του νερού, την ανάπτυξη εργαλείων ποσοτικής μικροβιολογίας (μαθηματικά μοντέλα) και προσδιορισμού επικινδυνότητας, την ανάπτυξη και εφαρμογή καινοτόμων μεθοδολογιών στην κατεύθυνση της βελτίωσης της της ασφάλειας στο νερό και καινοτόμων συσκευασιών τροφίμων. Άλλες ερευνητικές δράσεις της ομάδας: Μοριακή επιδημιολογική διερεύνηση επιδημιών/συρροών κρουσμάτων τροφιμογενών/υδατογενών λοιμώξεων, στη Μελέτη της διασποράς ανθεκτικών στελεχών και γονιδίων αντοχής στα αντιβιοτικά σε τρόφιμα, νερό και χώρους επεξεργασίας λυμάτων, στα πλαίσια προσέγγισης Ενιαίας Υγείας και στη Χρήση “Culturomics” για την ανίχνευση γονιδίων ανθεκτικότητας σε αντιβιοτικά σε νέους μικροοργανισμούς.

– ORCID: 0000-0003-2078-9822 (https://orcid.org/my-orcid?orcid=0000-0003-2078-9822)
– Google Scolar (Psaroulaki A): https://scholar.google.com/citations?user=kfAXADwAAAAJ&hl=en
– Pub Med: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=Psaroulaki+AAuthor&sort=date#
– Scopus AU-ID (“Psaroulaki, Anna” 6602337143)

Έχουν δημοσιευθεί περισσότερες από 150 εργασίες της σε διεθνή περιοδικά ή πρακτικά συνεδρίων (Original articles in Peer Review Journals or Publications in Journal Supplements/conference proceedings), και έχουν παρουσιαστεί περισσότερες από 165 εργασίες σε διεθνή ή ελληνικά συνέδρια (6 εκ των οποίων βραβεύτηκαν). Συμμετείχε στη συγγραφή κεφαλαίων σε ξενόγλωσσα συγγράμματα (6), και στην επιμέλεια μετάφρασης στην ελληνική 3 συγγραμμάτων Μικροβιολογίας.

Μέλος ευρωπαικών επιστημονικών εταιρειών και δικτύων (Ευρωπαική Εταιρεία Κλινικής Μικροβιολογίας και Λοιμώξεων (European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases- ESCMID), ESCAR (ESCMID Study Group for Coxiella, Anaplasma, Rickettsia , Bartonella); ESCMID Study Group for Legionella Infections (ESGLI), VBorNet (Vector Borne Disease Network)-Network of medical entomologists and public health experts, European Network for Vector and Vector borne diseases)