Το ΕΟΟ έχει ως κύριο σκοπό την ανάπτυξη βασικής, τεχνολογικής και εφαρμοσμένης έρευνας και την προώθηση των επιστημών που σχετίζονται με το γνωστικό αντικείμενο της Οπτικής και της Όρασης. Το Εργαστήριο φιλοδοξεί να καταστεί πυρήνας παραγωγής και διάχυσης νέας γνώσης με στόχο την πρόοδο των Επιστημών της Οπτικής και της Όρασης. Η μεταφραστική έρευνα με στόχο τη γνώση που αφορά στον άνθρωπο και στα προβλήματά του, αποτελούν πρώτη προτεραιότητα του Εργαστηρίου.

Για την υλοποίηση του σκοπού του το Εργαστήριο θέτει επιμέρους στόχους που αφορούν την Έρευνα, την Εκπαίδευση και την παροχή εξειδικευμένων και πρωτοποριακών σε παγκόσμιο επίπεδο υπηρεσιών υγείας.