Η μονάδα υποστηρίζει συγκριτική ανάλυση γονιδιωμάτων και πρωτεϊνών από εξελικτική σκοπιά.

Οι αναλύσεις αυτές στοχεύουν:

• στον εντοπισμό διατηρημένων γονιδίων
• στην εξαγωγή λειτουργικών σχέσεων
• στη διερεύνηση των εξελικτικών μηχανισμών που διαμορφώνουν τα βιολογικά συστήματα μεταξύ ειδών.

Οι αναλυτικές δυνατότητες περιλαμβάνουν:

• σύγκριση γονιδιωμάτων και εξελικτική ανάλυση για την αναγνώριση διατηρημένων γονιδιωματικών περιοχών και προσαρμογών ειδικών για συγκεκριμένες εξελικτικές γραμμές
• αναγνώριση και ανάλυση οικογενειών πρωτεϊνών, συμπεριλαμβανομένης της ομαδοποίησης ομόλογων πρωτεϊνών και της μελέτης της αρχιτεκτονικής πρωτεϊνικών δομικών περιοχών
• φυλογενετική ανάλυση για την ανακατασκευή εξελικτικών σχέσεων μεταξύ γονιδίων, πρωτεϊνών και ειδών
• ανάλυση γειτονιάς γονιδίων (gene neighborhood) για τη μελέτη διατηρημένης γονιδιωματικής οργάνωσης και συμφραζομένων γονιδίων σε πολλαπλά γονιδιώματα
• φυλογενετική προφίλωση (profiling) για τον εντοπισμό λειτουργικά σχετιζόμενων γονιδίων βάσει κοινών προτύπων παρουσίας ή απουσίας σε μεγάλο αριθμό γονιδιωμάτων
• ανίχνευση συγχωνεύσεων γονιδίων ή πρωτεϊνών μεταξύ γονιδιωμάτων, οι οποίες μπορούν να παρέχουν ισχυρές ενδείξεις για λειτουργικές συσχετίσεις μεταξύ πρωτεϊνών και βιολογικών μονοπατιών

Οι προσεγγίσεις αυτές υποστηρίζουν την ανακάλυψη διατηρημένων λειτουργικών μονάδων, την πρόβλεψη λειτουργίας γονιδίων και τη μελέτη της μοριακής εξέλιξης μεταξύ οργανισμών.